読み込むCSVファイルの一行目が列名の時、メイン画面のメニューから「CSVファイル」-「CSVファイルの一行目は列名」をチェックすると、一行目を列名として扱います。

一行目を列名に設定すると、CSVファイルを追記で保存するとき、一行目は保存しません。
新規に保存するときは、一行目も保存します。